Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRM3Q9NNZ6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRM3Q9NNZ6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRM3Q9NNZ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRM3Q9NNZ6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRM3Q9NNZ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRM3Q9NNZ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRM3Q9NNZ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRM3Q9NNZ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRM3Q9NNZ6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRM3Q9NNZ6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRM3Q9NNZ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRM3Q9NNZ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRM3Q9NNZ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRM3Q9NNZ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRM3Q9NNZ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRM3Q9NNZ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRM3Q9NNZ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRM3Q9NNZ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRM3Q9NNZ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRM3Q9NNZ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRM3Q9NNZ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRM3Q9NNZ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRM3Q9NNZ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRM3Q9NNZ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRM3Q9NNZ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRM3Q9NNZ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRM3Q9NNZ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRM3Q9NNZ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRM3Q9NNZ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRM3Q9NNZ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRM3Q9NNZ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRM3Q9NNZ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRM3Q9NNZ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRM3Q9NNZ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRM3Q9NNZ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRM3Q9NNZ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRM3Q9NNZ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRM3Q9NNZ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRM3Q9NNZ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRM3Q9NNZ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRM3Q9NNZ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRM3Q9NNZ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRM3Q9NNZ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRM3Q9NNZ6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRM3Q9NNZ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRM3Q9NNZ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRM3Q9NNZ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRM3Q9NNZ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRM3Q9NNZ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRM3Q9NNZ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRM3Q9NNZ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRM3Q9NNZ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRM3Q9NNZ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRM3Q9NNZ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRM3Q9NNZ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRM3Q9NNZ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRM3Q9NNZ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRM3Q9NNZ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRM3Q9NNZ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRM3Q9NNZ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRM3Q9NNZ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRM3Q9NNZ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRM3Q9NNZ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRM3Q9NNZ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRM3Q9NNZ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRM3Q9NNZ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRM3Q9NNZ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRM3Q9NNZ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRM3Q9NNZ6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRM3Q9NNZ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRM3Q9NNZ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRM3Q9NNZ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRM3Q9NNZ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRM3Q9NNZ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRM3Q9NNZ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRM3Q9NNZ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRM3Q9NNZ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRM3Q9NNZ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRM3Q9NNZ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRM3Q9NNZ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRM3Q9NNZ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRM3Q9NNZ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRM3Q9NNZ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRM3Q9NNZ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRM3Q9NNZ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRM3Q9NNZ6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRM3Q9NNZ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRM3Q9NNZ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRM3Q9NNZ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRM3Q9NNZ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRM3Q9NNZ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRM3Q9NNZ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRM3Q9NNZ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRM3Q9NNZ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRM3Q9NNZ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRM3Q9NNZ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRM3Q9NNZ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRM3Q9NNZ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRM3Q9NNZ6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms