Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.523e-11■■■■■ 48.5
FUBP3Q96I24 SPP1-203ENST00000395080 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-15■■■■■ 48
FUBP3Q96I24 SPP1-211ENST00000614857 1558 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.681e-15■■■■■ 48
FUBP3Q96I24 SPP1-201ENST00000237623 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.951e-15■■■■■ 48
FUBP3Q96I24 SPP1-209ENST00000509659 1664 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.281e-15■■■■■ 48
FUBP3Q96I24 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 48
FUBP3Q96I24 AC118553.2-208ENST00000640357 3488 ntTSL 513.35□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 48
FUBP3Q96I24 AC118553.2-206ENST00000639171 5352 ntTSL 511.28□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 48
FUBP3Q96I24 SCARB2-212ENST00000638663 1922 ntTSL 522.59■■□□□ 1.212e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.112e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-213ENST00000638680 5817 ntTSL 517.98■□□□□ 0.472e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.412e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-221ENST00000640341 3403 ntTSL 514.38□□□□□ -0.112e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-216ENST00000639300 4554 ntTSL 514.33□□□□□ -0.122e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.212e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.372e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-225ENST00000640900 531 ntTSL 29.69□□□□□ -0.862e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-224ENST00000640880 554 ntTSL 48.6□□□□□ -1.032e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.122e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.322e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 SCARB2-218ENST00000639715 4355 ntTSL 55.54□□□□□ -1.522e-19■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 IL1RAP-203ENST00000342550 4490 ntTSL 28.07□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.212e-8■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 IL1RAP-206ENST00000413869 4577 ntTSL 27.04□□□□□ -1.282e-8■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.312e-8■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.532e-8■■■■■ 47.5
FUBP3Q96I24 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 47.4
FUBP3Q96I24 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 47.1
FUBP3Q96I24 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 46.9
FUBP3Q96I24 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.266e-10■■■■■ 46.6
FUBP3Q96I24 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.088e-27■■■■■ 46.4
FUBP3Q96I24 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.328e-27■■■■■ 46.4
FUBP3Q96I24 MCFD2-207ENST00000409913 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.88e-27■■■■■ 46.4
FUBP3Q96I24 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.328e-27■■■■■ 46.4
FUBP3Q96I24 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.398e-27■■■■■ 46.4
FUBP3Q96I24 PCK1-201ENST00000319441 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.731e-15■■■■■ 46.4
FUBP3Q96I24 PCK1-202ENST00000467047 5074 ntTSL 1 (best)10.44□□□□□ -0.741e-15■■■■■ 46.4
FUBP3Q96I24 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 46.3
FUBP3Q96I24 C10orf10-203ENST00000496638 868 ntTSL 323.12■■□□□ 1.297e-25■■■■■ 46.3
FUBP3Q96I24 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.257e-25■■■■■ 46.3
FUBP3Q96I24 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-20■■■■■ 46.1
FUBP3Q96I24 ITM2B-203ENST00000463839 810 ntTSL 35.69□□□□□ -1.52e-20■■■■■ 46.1
FUBP3Q96I24 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.441e-9■■■■■ 45.8
FUBP3Q96I24 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-9■■■■■ 45.8
FUBP3Q96I24 SNRK-206ENST00000468628 470 ntTSL 38.63□□□□□ -1.031e-9■■■■■ 45.8
FUBP3Q96I24 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.075e-9■■■■■ 45.2
FUBP3Q96I24 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.57e-18■■■■■ 44.6
FUBP3Q96I24 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.26e-10■■■■■ 44.4
FUBP3Q96I24 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.263e-8■■■■■ 44
FUBP3Q96I24 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-11■■■■■ 43.9
FUBP3Q96I24 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-11■■■■■ 43.9
FUBP3Q96I24 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-11■■■■■ 43.9
FUBP3Q96I24 CLDN1-201ENST00000295522 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.883e-11■■■■■ 43.9
FUBP3Q96I24 ATP2B1-211ENST00000635033 1358 ntTSL 58.96□□□□□ -0.983e-11■■■■■ 43.9
FUBP3Q96I24 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.13e-11■■■■■ 43.9
FUBP3Q96I24 PPP1R8-205ENST00000486634 459 ntTSL 35.97□□□□□ -1.453e-11■■■■■ 43.9
FUBP3Q96I24 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.763e-11■■■■■ 43.9
FUBP3Q96I24 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.953e-11■■■■■ 43.9
FUBP3Q96I24 PPP1R12A-202ENST00000437004 4639 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 43.7
FUBP3Q96I24 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.084e-12■■■■■ 43.6
FUBP3Q96I24 MAP2K1-203ENST00000566326 1432 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.724e-12■■■■■ 43.6
FUBP3Q96I24 CMIP-206ENST00000565029 1559 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 43.5
FUBP3Q96I24 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 43.1
FUBP3Q96I24 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 43.1
FUBP3Q96I24 BCL6-203ENST00000419510 4178 ntTSL 28.87□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 43.1
FUBP3Q96I24 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 42.9
FUBP3Q96I24 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 42.9
FUBP3Q96I24 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 42.9
FUBP3Q96I24 ZBTB44-203ENST00000445008 3848 ntTSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 42.4
FUBP3Q96I24 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 42.4
FUBP3Q96I24 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 42.4
FUBP3Q96I24 IBTK-205ENST00000503400 5239 ntTSL 1 (best)6.39□□□□□ -1.398e-8■■■■■ 42.4
FUBP3Q96I24 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 41.9
FUBP3Q96I24 MEF2A-213ENST00000561125 1329 ntTSL 510.28□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 41.9
FUBP3Q96I24 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 41.9
FUBP3Q96I24 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 41.9
FUBP3Q96I24 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 41.9
FUBP3Q96I24 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 41.7
FUBP3Q96I24 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 41.7
FUBP3Q96I24 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 41.7
FUBP3Q96I24 ARPC5-204ENST00000462965 2455 ntTSL 25.15□□□□□ -1.581e-8■■■■■ 41.7
FUBP3Q96I24 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.691e-75■■■■■ 41.6
FUBP3Q96I24 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.481e-75■■■■■ 41.6
FUBP3Q96I24 H3F3B-204ENST00000586607 551 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.731e-75■■■■■ 41.6
FUBP3Q96I24 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 41.6
FUBP3Q96I24 PPFIA1-225ENST00000638133 814 ntTSL 315.94■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 41.6
FUBP3Q96I24 PPFIA1-204ENST00000525922 358 ntTSL 38.34□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 41.6
FUBP3Q96I24 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 41.5
FUBP3Q96I24 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 41.3
FUBP3Q96I24 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 41.3
FUBP3Q96I24 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 41.3
FUBP3Q96I24 SLC7A6-202ENST00000379152 5074 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -16e-7■■■■■ 41.3
FUBP3Q96I24 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 41.3
FUBP3Q96I24 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.266e-7■■■■■ 41.3
FUBP3Q96I24 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 41.3
FUBP3Q96I24 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 41.3
FUBP3Q96I24 ZCCHC14-204ENST00000568020 6242 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.414e-9■■■■■ 41.1
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 344 ms