RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.63■■■□□ 2.49
SCARB2-201ENST00000264896 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.52■■■□□ 2.48
SCARB2-201ENST00000264896 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SCARB2-201ENST00000264896 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.06■■■□□ 2.24
SCARB2-201ENST00000264896 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.07■■■□□ 2.08
SCARB2-201ENST00000264896 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
SCARB2-201ENST00000264896 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.65■■■□□ 2.02
SCARB2-201ENST00000264896 APLP2Q06481 763 aa27.51■■□□□ 1.99
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM41Q8WV44 630 aa27.35■■□□□ 1.97
SCARB2-201ENST00000264896 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
SCARB2-201ENST00000264896 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SCARB2-201ENST00000264896 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SCARB2-201ENST00000264896 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SCARB2-201ENST00000264896 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SCARB2-201ENST00000264896 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SCARB2-201ENST00000264896 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SCARB2-201ENST00000264896 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.73■■□□□ 1.87
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SCARB2-201ENST00000264896 HRCP23327 699 aa26.54■■□□□ 1.84
SCARB2-201ENST00000264896 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.51■■□□□ 1.83
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SCARB2-201ENST00000264896 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
SCARB2-201ENST00000264896 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SCARB2-201ENST00000264896 NEFLP07196 543 aa25.93■■□□□ 1.74
SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SCARB2-201ENST00000264896 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.87■■□□□ 1.73
SCARB2-201ENST00000264896 ITGAEP38570 1179 aa25.84■■□□□ 1.73
SCARB2-201ENST00000264896 ABCC9O60706 1549 aa25.78■■□□□ 1.72
SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
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SCARB2-201ENST00000264896 MYT1Q01538 1121 aa25.53■■□□□ 1.68
SCARB2-201ENST00000264896 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
SCARB2-201ENST00000264896 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.31■■□□□ 1.64
SCARB2-201ENST00000264896 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SCARB2-201ENST00000264896 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.25■■□□□ 1.63
SCARB2-201ENST00000264896 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.12■■□□□ 1.61
SCARB2-201ENST00000264896 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SCARB2-201ENST00000264896 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.07■■□□□ 1.6
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SCARB2-201ENST00000264896 NEUROD1Q13562 356 aa25.05■■□□□ 1.6
SCARB2-201ENST00000264896 SCRIBQ14160 1630 aa25.03■■□□□ 1.6
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.02■■□□□ 1.6
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM52Q96A61 297 aa25■■□□□ 1.59
SCARB2-201ENST00000264896 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25■■□□□ 1.59
SCARB2-201ENST00000264896 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SCARB2-201ENST00000264896 ANP32CO43423 234 aa24.83■■□□□ 1.56
SCARB2-201ENST00000264896 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SCARB2-201ENST00000264896 P3H3Q8IVL6 736 aa24.78■■□□□ 1.56
SCARB2-201ENST00000264896 BCANQ96GW7 911 aa24.67■■□□□ 1.54
SCARB2-201ENST00000264896 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.66■■□□□ 1.54
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
SCARB2-201ENST00000264896 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SCARB2-201ENST00000264896 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SCARB2-201ENST00000264896 FBLN2P98095 1184 aa24.59■■□□□ 1.53
SCARB2-201ENST00000264896 ARID3CA6NKF2 412 aa24.5■■□□□ 1.51
SCARB2-201ENST00000264896 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SCARB2-201ENST00000264896 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.47■■□□□ 1.51
SCARB2-201ENST00000264896 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SCARB2-201ENST00000264896 CLIP1P30622 1438 aa24.38■■□□□ 1.49
SCARB2-201ENST00000264896 TONSLQ96HA7 1378 aa24.38■■□□□ 1.49
SCARB2-201ENST00000264896 EEA1Q15075 1411 aa24.37■■□□□ 1.49
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SCARB2-201ENST00000264896 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.32■■□□□ 1.48
SCARB2-201ENST00000264896 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SCARB2-201ENST00000264896 CEP162Q5TB80 1403 aa24.29■■□□□ 1.48
SCARB2-201ENST00000264896 NACADO15069 1562 aa24.26■■□□□ 1.47
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA3Q08378 1498 aa24.24■■□□□ 1.47
SCARB2-201ENST00000264896 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
SCARB2-201ENST00000264896 FKBP8Q14318 412 aa24.18■■□□□ 1.46
SCARB2-201ENST00000264896 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.17■■□□□ 1.46
SCARB2-201ENST00000264896 MIER1Q8N108 512 aa24.17■■□□□ 1.46
SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.46
SCARB2-201ENST00000264896 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.14■■□□□ 1.45
SCARB2-201ENST00000264896 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.12■■□□□ 1.45
SCARB2-201ENST00000264896 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SCARB2-201ENST00000264896 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.04■■□□□ 1.44
SCARB2-201ENST00000264896 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.03■■□□□ 1.44
SCARB2-201ENST00000264896 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.02■■□□□ 1.44
SCARB2-201ENST00000264896 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SCARB2-201ENST00000264896 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SCARB2-201ENST00000264896 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SCARB2-201ENST00000264896 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SCARB2-201ENST00000264896 KIF27Q86VH2 1401 aa23.95■■□□□ 1.42
SCARB2-201ENST00000264896 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SCARB2-201ENST00000264896 TSPY4P0CV99 314 aa23.92■■□□□ 1.42
SCARB2-201ENST00000264896 TSPY10P0CW01 314 aa23.92■■□□□ 1.42
SCARB2-201ENST00000264896 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SCARB2-201ENST00000264896 NEFMP07197 916 aa23.91■■□□□ 1.42
SCARB2-201ENST00000264896 TMC1Q8TDI8 760 aa23.88■■□□□ 1.41
SCARB2-201ENST00000264896 MRS2Q9HD23 443 aa23.88■■□□□ 1.41
SCARB2-201ENST00000264896 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.86■■□□□ 1.41
SCARB2-201ENST00000264896 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
SCARB2-201ENST00000264896 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SCARB2-201ENST00000264896 SOGA1O94964 1423 aa23.8■■□□□ 1.4
SCARB2-201ENST00000264896 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SCARB2-201ENST00000264896 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
SCARB2-201ENST00000264896 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SCARB2-201ENST00000264896 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.78■■□□□ 1.4
SCARB2-201ENST00000264896 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
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