Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV4

MYO3A, Myosin-IIIa, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO3AQ8NEV4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
MYO3AQ8NEV4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
MYO3AQ8NEV4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
MYO3AQ8NEV4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
MYO3AQ8NEV4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
MYO3AQ8NEV4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
MYO3AQ8NEV4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
MYO3AQ8NEV4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.65■■■■■ 4.58
MYO3AQ8NEV4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
MYO3AQ8NEV4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
MYO3AQ8NEV4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
MYO3AQ8NEV4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
MYO3AQ8NEV4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
MYO3AQ8NEV4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
MYO3AQ8NEV4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
MYO3AQ8NEV4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
MYO3AQ8NEV4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.2■■■■■ 4.51
MYO3AQ8NEV4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.19■■■■■ 4.51
MYO3AQ8NEV4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
MYO3AQ8NEV4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
MYO3AQ8NEV4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
MYO3AQ8NEV4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
MYO3AQ8NEV4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
MYO3AQ8NEV4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
MYO3AQ8NEV4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
MYO3AQ8NEV4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
MYO3AQ8NEV4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
MYO3AQ8NEV4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
MYO3AQ8NEV4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
MYO3AQ8NEV4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
MYO3AQ8NEV4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
MYO3AQ8NEV4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
MYO3AQ8NEV4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
MYO3AQ8NEV4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
MYO3AQ8NEV4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
MYO3AQ8NEV4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
MYO3AQ8NEV4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
MYO3AQ8NEV4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
MYO3AQ8NEV4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
MYO3AQ8NEV4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
MYO3AQ8NEV4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
MYO3AQ8NEV4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
MYO3AQ8NEV4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.43
MYO3AQ8NEV4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
MYO3AQ8NEV4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
MYO3AQ8NEV4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
MYO3AQ8NEV4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
MYO3AQ8NEV4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
MYO3AQ8NEV4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
MYO3AQ8NEV4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
MYO3AQ8NEV4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
MYO3AQ8NEV4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
MYO3AQ8NEV4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
MYO3AQ8NEV4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
MYO3AQ8NEV4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
MYO3AQ8NEV4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
MYO3AQ8NEV4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
MYO3AQ8NEV4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
MYO3AQ8NEV4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
MYO3AQ8NEV4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
MYO3AQ8NEV4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
MYO3AQ8NEV4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
MYO3AQ8NEV4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
MYO3AQ8NEV4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
MYO3AQ8NEV4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
MYO3AQ8NEV4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
MYO3AQ8NEV4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
MYO3AQ8NEV4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
MYO3AQ8NEV4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
MYO3AQ8NEV4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
MYO3AQ8NEV4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
MYO3AQ8NEV4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
MYO3AQ8NEV4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
MYO3AQ8NEV4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
MYO3AQ8NEV4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
MYO3AQ8NEV4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
MYO3AQ8NEV4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
MYO3AQ8NEV4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
MYO3AQ8NEV4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
MYO3AQ8NEV4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
MYO3AQ8NEV4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
MYO3AQ8NEV4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
MYO3AQ8NEV4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
MYO3AQ8NEV4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
MYO3AQ8NEV4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
MYO3AQ8NEV4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
MYO3AQ8NEV4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
MYO3AQ8NEV4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
MYO3AQ8NEV4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
MYO3AQ8NEV4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
MYO3AQ8NEV4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.85■■■■■ 4.29
MYO3AQ8NEV4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
MYO3AQ8NEV4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
MYO3AQ8NEV4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
MYO3AQ8NEV4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
MYO3AQ8NEV4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
MYO3AQ8NEV4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
MYO3AQ8NEV4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
MYO3AQ8NEV4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
MYO3AQ8NEV4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms