Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHCHD4Q8N4Q1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4Q8N4Q1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHCHD4Q8N4Q1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHCHD4Q8N4Q1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHCHD4Q8N4Q1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHCHD4Q8N4Q1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHCHD4Q8N4Q1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHCHD4Q8N4Q1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHCHD4Q8N4Q1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHCHD4Q8N4Q1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHCHD4Q8N4Q1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHCHD4Q8N4Q1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHCHD4Q8N4Q1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHCHD4Q8N4Q1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHCHD4Q8N4Q1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHCHD4Q8N4Q1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHCHD4Q8N4Q1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHCHD4Q8N4Q1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHCHD4Q8N4Q1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHCHD4Q8N4Q1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHCHD4Q8N4Q1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHCHD4Q8N4Q1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHCHD4Q8N4Q1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHCHD4Q8N4Q1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHCHD4Q8N4Q1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHCHD4Q8N4Q1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHCHD4Q8N4Q1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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