Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED13LQ71F56 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED13LQ71F56 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED13LQ71F56 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED13LQ71F56 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED13LQ71F56 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MED13LQ71F56 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MED13LQ71F56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MED13LQ71F56 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MED13LQ71F56 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED13LQ71F56 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MED13LQ71F56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED13LQ71F56 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED13LQ71F56 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED13LQ71F56 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED13LQ71F56 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED13LQ71F56 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED13LQ71F56 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED13LQ71F56 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED13LQ71F56 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED13LQ71F56 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED13LQ71F56 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED13LQ71F56 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED13LQ71F56 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED13LQ71F56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED13LQ71F56 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED13LQ71F56 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED13LQ71F56 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED13LQ71F56 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MED13LQ71F56 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED13LQ71F56 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED13LQ71F56 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED13LQ71F56 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED13LQ71F56 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MED13LQ71F56 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED13LQ71F56 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED13LQ71F56 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED13LQ71F56 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MED13LQ71F56 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED13LQ71F56 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED13LQ71F56 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED13LQ71F56 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED13LQ71F56 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MED13LQ71F56 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED13LQ71F56 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED13LQ71F56 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MED13LQ71F56 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED13LQ71F56 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED13LQ71F56 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED13LQ71F56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED13LQ71F56 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED13LQ71F56 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED13LQ71F56 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED13LQ71F56 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED13LQ71F56 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED13LQ71F56 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MED13LQ71F56 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED13LQ71F56 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED13LQ71F56 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED13LQ71F56 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED13LQ71F56 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED13LQ71F56 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED13LQ71F56 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED13LQ71F56 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED13LQ71F56 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED13LQ71F56 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED13LQ71F56 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED13LQ71F56 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED13LQ71F56 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED13LQ71F56 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED13LQ71F56 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED13LQ71F56 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED13LQ71F56 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED13LQ71F56 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED13LQ71F56 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED13LQ71F56 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED13LQ71F56 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED13LQ71F56 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED13LQ71F56 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED13LQ71F56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED13LQ71F56 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED13LQ71F56 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED13LQ71F56 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED13LQ71F56 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MED13LQ71F56 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED13LQ71F56 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED13LQ71F56 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MED13LQ71F56 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.6 ms