Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTL4Q6ZR62 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTL4Q6ZR62 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTL4Q6ZR62 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTL4Q6ZR62 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTL4Q6ZR62 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTL4Q6ZR62 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTL4Q6ZR62 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTL4Q6ZR62 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTL4Q6ZR62 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTL4Q6ZR62 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTL4Q6ZR62 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTL4Q6ZR62 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTL4Q6ZR62 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTL4Q6ZR62 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTL4Q6ZR62 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTL4Q6ZR62 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTL4Q6ZR62 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RTL4Q6ZR62 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTL4Q6ZR62 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTL4Q6ZR62 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTL4Q6ZR62 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTL4Q6ZR62 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTL4Q6ZR62 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTL4Q6ZR62 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTL4Q6ZR62 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTL4Q6ZR62 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTL4Q6ZR62 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTL4Q6ZR62 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTL4Q6ZR62 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTL4Q6ZR62 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTL4Q6ZR62 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTL4Q6ZR62 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTL4Q6ZR62 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTL4Q6ZR62 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RTL4Q6ZR62 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTL4Q6ZR62 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTL4Q6ZR62 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RTL4Q6ZR62 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTL4Q6ZR62 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTL4Q6ZR62 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTL4Q6ZR62 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTL4Q6ZR62 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTL4Q6ZR62 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTL4Q6ZR62 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTL4Q6ZR62 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RTL4Q6ZR62 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTL4Q6ZR62 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTL4Q6ZR62 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTL4Q6ZR62 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTL4Q6ZR62 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTL4Q6ZR62 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTL4Q6ZR62 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTL4Q6ZR62 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTL4Q6ZR62 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTL4Q6ZR62 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTL4Q6ZR62 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTL4Q6ZR62 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTL4Q6ZR62 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTL4Q6ZR62 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTL4Q6ZR62 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTL4Q6ZR62 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTL4Q6ZR62 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTL4Q6ZR62 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTL4Q6ZR62 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTL4Q6ZR62 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTL4Q6ZR62 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTL4Q6ZR62 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTL4Q6ZR62 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTL4Q6ZR62 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTL4Q6ZR62 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTL4Q6ZR62 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTL4Q6ZR62 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTL4Q6ZR62 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTL4Q6ZR62 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTL4Q6ZR62 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL4Q6ZR62 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTL4Q6ZR62 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL4Q6ZR62 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL4Q6ZR62 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTL4Q6ZR62 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTL4Q6ZR62 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL4Q6ZR62 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL4Q6ZR62 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL4Q6ZR62 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL4Q6ZR62 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL4Q6ZR62 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTL4Q6ZR62 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTL4Q6ZR62 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTL4Q6ZR62 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTL4Q6ZR62 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTL4Q6ZR62 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTL4Q6ZR62 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTL4Q6ZR62 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTL4Q6ZR62 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTL4Q6ZR62 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTL4Q6ZR62 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTL4Q6ZR62 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTL4Q6ZR62 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTL4Q6ZR62 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms