Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLIPQ5VWP3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MLIPQ5VWP3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MLIPQ5VWP3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLIPQ5VWP3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLIPQ5VWP3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLIPQ5VWP3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MLIPQ5VWP3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLIPQ5VWP3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MLIPQ5VWP3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLIPQ5VWP3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MLIPQ5VWP3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLIPQ5VWP3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLIPQ5VWP3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLIPQ5VWP3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLIPQ5VWP3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLIPQ5VWP3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLIPQ5VWP3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLIPQ5VWP3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLIPQ5VWP3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MLIPQ5VWP3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MLIPQ5VWP3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLIPQ5VWP3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLIPQ5VWP3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLIPQ5VWP3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLIPQ5VWP3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLIPQ5VWP3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MLIPQ5VWP3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLIPQ5VWP3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLIPQ5VWP3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLIPQ5VWP3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLIPQ5VWP3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLIPQ5VWP3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLIPQ5VWP3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLIPQ5VWP3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLIPQ5VWP3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLIPQ5VWP3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLIPQ5VWP3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLIPQ5VWP3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLIPQ5VWP3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLIPQ5VWP3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLIPQ5VWP3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLIPQ5VWP3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLIPQ5VWP3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLIPQ5VWP3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLIPQ5VWP3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLIPQ5VWP3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLIPQ5VWP3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLIPQ5VWP3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLIPQ5VWP3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLIPQ5VWP3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLIPQ5VWP3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLIPQ5VWP3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLIPQ5VWP3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MLIPQ5VWP3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLIPQ5VWP3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLIPQ5VWP3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLIPQ5VWP3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLIPQ5VWP3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLIPQ5VWP3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLIPQ5VWP3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLIPQ5VWP3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLIPQ5VWP3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLIPQ5VWP3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLIPQ5VWP3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MLIPQ5VWP3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLIPQ5VWP3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MLIPQ5VWP3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MLIPQ5VWP3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MLIPQ5VWP3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLIPQ5VWP3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLIPQ5VWP3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLIPQ5VWP3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLIPQ5VWP3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLIPQ5VWP3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLIPQ5VWP3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MLIPQ5VWP3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MLIPQ5VWP3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MLIPQ5VWP3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MLIPQ5VWP3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MLIPQ5VWP3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MLIPQ5VWP3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLIPQ5VWP3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLIPQ5VWP3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLIPQ5VWP3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MLIPQ5VWP3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLIPQ5VWP3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLIPQ5VWP3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms