Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD5Q5TGI4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD5Q5TGI4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD5Q5TGI4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD5Q5TGI4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD5Q5TGI4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD5Q5TGI4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD5Q5TGI4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD5Q5TGI4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD5Q5TGI4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD5Q5TGI4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD5Q5TGI4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD5Q5TGI4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD5Q5TGI4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SAMD5Q5TGI4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD5Q5TGI4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD5Q5TGI4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD5Q5TGI4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD5Q5TGI4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD5Q5TGI4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD5Q5TGI4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD5Q5TGI4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD5Q5TGI4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD5Q5TGI4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD5Q5TGI4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD5Q5TGI4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD5Q5TGI4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD5Q5TGI4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD5Q5TGI4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD5Q5TGI4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAMD5Q5TGI4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD5Q5TGI4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD5Q5TGI4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD5Q5TGI4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD5Q5TGI4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD5Q5TGI4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD5Q5TGI4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD5Q5TGI4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD5Q5TGI4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD5Q5TGI4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD5Q5TGI4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD5Q5TGI4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD5Q5TGI4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD5Q5TGI4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD5Q5TGI4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD5Q5TGI4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD5Q5TGI4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD5Q5TGI4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD5Q5TGI4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMD5Q5TGI4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMD5Q5TGI4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD5Q5TGI4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD5Q5TGI4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD5Q5TGI4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD5Q5TGI4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD5Q5TGI4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD5Q5TGI4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD5Q5TGI4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD5Q5TGI4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD5Q5TGI4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD5Q5TGI4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD5Q5TGI4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD5Q5TGI4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD5Q5TGI4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD5Q5TGI4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD5Q5TGI4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD5Q5TGI4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD5Q5TGI4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD5Q5TGI4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD5Q5TGI4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD5Q5TGI4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD5Q5TGI4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD5Q5TGI4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD5Q5TGI4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD5Q5TGI4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD5Q5TGI4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD5Q5TGI4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD5Q5TGI4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD5Q5TGI4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms