Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF14Q5SWL7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF14Q5SWL7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF14Q5SWL7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF14Q5SWL7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF14Q5SWL7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF14Q5SWL7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF14Q5SWL7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF14Q5SWL7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF14Q5SWL7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF14Q5SWL7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF14Q5SWL7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF14Q5SWL7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF14Q5SWL7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF14Q5SWL7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF14Q5SWL7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF14Q5SWL7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF14Q5SWL7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF14Q5SWL7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF14Q5SWL7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF14Q5SWL7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF14Q5SWL7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF14Q5SWL7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF14Q5SWL7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF14Q5SWL7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF14Q5SWL7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF14Q5SWL7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF14Q5SWL7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF14Q5SWL7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF14Q5SWL7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF14Q5SWL7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF14Q5SWL7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF14Q5SWL7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF14Q5SWL7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF14Q5SWL7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF14Q5SWL7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF14Q5SWL7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF14Q5SWL7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF14Q5SWL7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF14Q5SWL7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF14Q5SWL7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF14Q5SWL7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF14Q5SWL7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF14Q5SWL7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF14Q5SWL7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF14Q5SWL7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF14Q5SWL7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF14Q5SWL7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF14Q5SWL7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF14Q5SWL7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF14Q5SWL7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF14Q5SWL7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF14Q5SWL7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF14Q5SWL7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF14Q5SWL7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF14Q5SWL7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF14Q5SWL7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF14Q5SWL7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF14Q5SWL7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF14Q5SWL7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF14Q5SWL7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF14Q5SWL7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF14Q5SWL7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF14Q5SWL7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF14Q5SWL7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF14Q5SWL7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF14Q5SWL7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF14Q5SWL7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF14Q5SWL7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF14Q5SWL7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF14Q5SWL7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF14Q5SWL7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF14Q5SWL7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF14Q5SWL7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF14Q5SWL7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF14Q5SWL7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF14Q5SWL7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF14Q5SWL7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF14Q5SWL7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF14Q5SWL7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF14Q5SWL7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRAMEF14Q5SWL7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF14Q5SWL7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF14Q5SWL7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF14Q5SWL7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF14Q5SWL7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.2 ms