Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf48Q5BLP8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf48Q5BLP8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf48Q5BLP8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf48Q5BLP8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf48Q5BLP8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf48Q5BLP8 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf48Q5BLP8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4orf48Q5BLP8 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf48Q5BLP8 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf48Q5BLP8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf48Q5BLP8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf48Q5BLP8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf48Q5BLP8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf48Q5BLP8 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf48Q5BLP8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf48Q5BLP8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf48Q5BLP8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf48Q5BLP8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf48Q5BLP8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf48Q5BLP8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf48Q5BLP8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf48Q5BLP8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf48Q5BLP8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf48Q5BLP8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf48Q5BLP8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf48Q5BLP8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf48Q5BLP8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf48Q5BLP8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf48Q5BLP8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf48Q5BLP8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C4orf48Q5BLP8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf48Q5BLP8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf48Q5BLP8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf48Q5BLP8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf48Q5BLP8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf48Q5BLP8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf48Q5BLP8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf48Q5BLP8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf48Q5BLP8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf48Q5BLP8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf48Q5BLP8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf48Q5BLP8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf48Q5BLP8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf48Q5BLP8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4orf48Q5BLP8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf48Q5BLP8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf48Q5BLP8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf48Q5BLP8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf48Q5BLP8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf48Q5BLP8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf48Q5BLP8 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf48Q5BLP8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf48Q5BLP8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4orf48Q5BLP8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf48Q5BLP8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf48Q5BLP8 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf48Q5BLP8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf48Q5BLP8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf48Q5BLP8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf48Q5BLP8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf48Q5BLP8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf48Q5BLP8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf48Q5BLP8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms