Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP20-2Q3LI61 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP20-2Q3LI61 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
KRTAP20-2Q3LI61 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP20-2Q3LI61 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP20-2Q3LI61 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP20-2Q3LI61 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP20-2Q3LI61 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP20-2Q3LI61 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP20-2Q3LI61 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP20-2Q3LI61 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP20-2Q3LI61 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
KRTAP20-2Q3LI61 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP20-2Q3LI61 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP20-2Q3LI61 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP20-2Q3LI61 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP20-2Q3LI61 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms