Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1CQ13936 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1CQ13936 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1CQ13936 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1CQ13936 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1CQ13936 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1CQ13936 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1CQ13936 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1CQ13936 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1CQ13936 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1CQ13936 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1CQ13936 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1CQ13936 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1CQ13936 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1CQ13936 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1CQ13936 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1CQ13936 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1CQ13936 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1CQ13936 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1CQ13936 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1CQ13936 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1CQ13936 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1CQ13936 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1CQ13936 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1CQ13936 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1CQ13936 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1CQ13936 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNA1CQ13936 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA1CQ13936 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1CQ13936 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1CQ13936 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1CQ13936 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1CQ13936 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1CQ13936 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1CQ13936 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1CQ13936 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1CQ13936 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1CQ13936 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1CQ13936 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1CQ13936 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1CQ13936 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1CQ13936 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1CQ13936 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1CQ13936 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1CQ13936 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1CQ13936 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1CQ13936 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1CQ13936 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1CQ13936 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1CQ13936 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1CQ13936 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1CQ13936 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1CQ13936 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1CQ13936 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1CQ13936 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1CQ13936 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1CQ13936 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1CQ13936 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1CQ13936 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1CQ13936 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1CQ13936 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1CQ13936 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1CQ13936 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1CQ13936 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1CQ13936 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA1CQ13936 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1CQ13936 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1CQ13936 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1CQ13936 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1CQ13936 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1CQ13936 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1CQ13936 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1CQ13936 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1CQ13936 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1CQ13936 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1CQ13936 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1CQ13936 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1CQ13936 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1CQ13936 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1CQ13936 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1CQ13936 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNA1CQ13936 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1CQ13936 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1CQ13936 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1CQ13936 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1CQ13936 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1CQ13936 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1CQ13936 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1CQ13936 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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