Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1BQ13112 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAF1BQ13112 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHAF1BQ13112 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHAF1BQ13112 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHAF1BQ13112 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHAF1BQ13112 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1BQ13112 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHAF1BQ13112 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHAF1BQ13112 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1BQ13112 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1BQ13112 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1BQ13112 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1BQ13112 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1BQ13112 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1BQ13112 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1BQ13112 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1BQ13112 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1BQ13112 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1BQ13112 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1BQ13112 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1BQ13112 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAF1BQ13112 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAF1BQ13112 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAF1BQ13112 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHAF1BQ13112 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHAF1BQ13112 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHAF1BQ13112 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1BQ13112 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1BQ13112 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHAF1BQ13112 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHAF1BQ13112 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1BQ13112 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1BQ13112 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAF1BQ13112 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAF1BQ13112 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAF1BQ13112 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1BQ13112 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1BQ13112 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1BQ13112 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAF1BQ13112 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1BQ13112 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAF1BQ13112 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAF1BQ13112 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1BQ13112 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAF1BQ13112 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAF1BQ13112 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAF1BQ13112 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAF1BQ13112 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAF1BQ13112 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1BQ13112 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAF1BQ13112 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAF1BQ13112 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAF1BQ13112 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAF1BQ13112 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAF1BQ13112 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAF1BQ13112 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1BQ13112 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1BQ13112 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1BQ13112 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1BQ13112 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1BQ13112 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1BQ13112 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1BQ13112 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1BQ13112 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1BQ13112 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAF1BQ13112 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1BQ13112 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1BQ13112 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1BQ13112 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1BQ13112 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1BQ13112 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1BQ13112 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAF1BQ13112 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1BQ13112 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1BQ13112 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAF1BQ13112 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1BQ13112 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1BQ13112 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHAF1BQ13112 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1BQ13112 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1BQ13112 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1BQ13112 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAF1BQ13112 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAF1BQ13112 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAF1BQ13112 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1BQ13112 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1BQ13112 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1BQ13112 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1BQ13112 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHAF1BQ13112 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAF1BQ13112 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHAF1BQ13112 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1BQ13112 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1BQ13112 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHAF1BQ13112 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHAF1BQ13112 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAF1BQ13112 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAF1BQ13112 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1BQ13112 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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