Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACACAQ13085 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACACAQ13085 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACACAQ13085 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACACAQ13085 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACACAQ13085 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACACAQ13085 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACACAQ13085 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACACAQ13085 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ACACAQ13085 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACACAQ13085 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACACAQ13085 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ACACAQ13085 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ACACAQ13085 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ACACAQ13085 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ACACAQ13085 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACACAQ13085 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACACAQ13085 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACACAQ13085 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACACAQ13085 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACACAQ13085 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ACACAQ13085 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACACAQ13085 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACACAQ13085 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACACAQ13085 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ACACAQ13085 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACACAQ13085 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACACAQ13085 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACACAQ13085 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACACAQ13085 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACACAQ13085 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACACAQ13085 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ACACAQ13085 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACACAQ13085 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACACAQ13085 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACACAQ13085 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACACAQ13085 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACACAQ13085 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACACAQ13085 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACACAQ13085 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACACAQ13085 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACACAQ13085 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACACAQ13085 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACACAQ13085 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACACAQ13085 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACACAQ13085 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACACAQ13085 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACACAQ13085 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ACACAQ13085 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACACAQ13085 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACACAQ13085 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACACAQ13085 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACACAQ13085 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACACAQ13085 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACACAQ13085 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACACAQ13085 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACACAQ13085 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACACAQ13085 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACACAQ13085 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ACACAQ13085 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACACAQ13085 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACACAQ13085 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACACAQ13085 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACACAQ13085 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACACAQ13085 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACACAQ13085 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ACACAQ13085 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACACAQ13085 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ACACAQ13085 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ACACAQ13085 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACACAQ13085 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ACACAQ13085 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACACAQ13085 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACACAQ13085 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACACAQ13085 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACACAQ13085 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACACAQ13085 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ACACAQ13085 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACACAQ13085 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACACAQ13085 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACACAQ13085 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACACAQ13085 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ACACAQ13085 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACACAQ13085 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACACAQ13085 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACACAQ13085 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACACAQ13085 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACACAQ13085 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACACAQ13085 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACACAQ13085 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACACAQ13085 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACACAQ13085 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACACAQ13085 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACACAQ13085 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACACAQ13085 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACACAQ13085 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACACAQ13085 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACACAQ13085 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACACAQ13085 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ACACAQ13085 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
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