Protein–RNA interactions for Protein: Q02817

MUC2, Mucin-2, humanhuman

Predictions only

Length 5,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC2Q02817 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC2Q02817 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC2Q02817 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC2Q02817 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MUC2Q02817 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUC2Q02817 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MUC2Q02817 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC2Q02817 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC2Q02817 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC2Q02817 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC2Q02817 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC2Q02817 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC2Q02817 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC2Q02817 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MUC2Q02817 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MUC2Q02817 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MUC2Q02817 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MUC2Q02817 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MUC2Q02817 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MUC2Q02817 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MUC2Q02817 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MUC2Q02817 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MUC2Q02817 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MUC2Q02817 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MUC2Q02817 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC2Q02817 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC2Q02817 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC2Q02817 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC2Q02817 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MUC2Q02817 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC2Q02817 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC2Q02817 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC2Q02817 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC2Q02817 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC2Q02817 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC2Q02817 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC2Q02817 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MUC2Q02817 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MUC2Q02817 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MUC2Q02817 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MUC2Q02817 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MUC2Q02817 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MUC2Q02817 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
MUC2Q02817 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MUC2Q02817 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MUC2Q02817 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MUC2Q02817 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC2Q02817 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC2Q02817 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MUC2Q02817 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC2Q02817 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC2Q02817 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MUC2Q02817 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MUC2Q02817 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MUC2Q02817 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MUC2Q02817 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC2Q02817 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC2Q02817 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC2Q02817 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC2Q02817 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC2Q02817 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC2Q02817 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MUC2Q02817 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC2Q02817 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC2Q02817 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC2Q02817 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC2Q02817 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC2Q02817 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC2Q02817 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MUC2Q02817 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MUC2Q02817 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MUC2Q02817 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC2Q02817 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC2Q02817 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC2Q02817 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms