Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SATB1Q01826 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SATB1Q01826 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SATB1Q01826 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SATB1Q01826 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SATB1Q01826 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SATB1Q01826 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SATB1Q01826 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SATB1Q01826 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SATB1Q01826 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SATB1Q01826 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SATB1Q01826 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SATB1Q01826 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SATB1Q01826 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SATB1Q01826 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SATB1Q01826 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SATB1Q01826 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SATB1Q01826 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SATB1Q01826 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SATB1Q01826 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SATB1Q01826 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SATB1Q01826 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SATB1Q01826 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SATB1Q01826 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SATB1Q01826 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SATB1Q01826 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SATB1Q01826 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SATB1Q01826 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SATB1Q01826 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SATB1Q01826 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SATB1Q01826 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SATB1Q01826 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SATB1Q01826 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SATB1Q01826 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SATB1Q01826 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SATB1Q01826 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SATB1Q01826 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SATB1Q01826 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SATB1Q01826 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SATB1Q01826 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SATB1Q01826 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SATB1Q01826 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SATB1Q01826 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SATB1Q01826 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SATB1Q01826 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SATB1Q01826 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SATB1Q01826 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SATB1Q01826 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SATB1Q01826 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SATB1Q01826 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SATB1Q01826 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SATB1Q01826 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SATB1Q01826 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SATB1Q01826 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SATB1Q01826 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SATB1Q01826 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SATB1Q01826 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SATB1Q01826 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SATB1Q01826 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SATB1Q01826 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SATB1Q01826 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SATB1Q01826 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SATB1Q01826 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SATB1Q01826 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SATB1Q01826 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SATB1Q01826 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SATB1Q01826 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SATB1Q01826 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SATB1Q01826 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SATB1Q01826 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SATB1Q01826 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SATB1Q01826 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SATB1Q01826 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SATB1Q01826 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SATB1Q01826 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SATB1Q01826 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SATB1Q01826 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SATB1Q01826 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SATB1Q01826 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SATB1Q01826 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SATB1Q01826 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SATB1Q01826 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SATB1Q01826 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SATB1Q01826 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SATB1Q01826 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SATB1Q01826 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SATB1Q01826 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SATB1Q01826 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SATB1Q01826 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SATB1Q01826 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SATB1Q01826 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SATB1Q01826 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SATB1Q01826 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SATB1Q01826 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SATB1Q01826 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SATB1Q01826 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SATB1Q01826 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SATB1Q01826 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SATB1Q01826 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SATB1Q01826 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms