Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1DQ01668 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1DQ01668 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1DQ01668 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1DQ01668 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1DQ01668 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1DQ01668 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1DQ01668 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1DQ01668 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1DQ01668 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1DQ01668 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1DQ01668 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1DQ01668 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1DQ01668 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1DQ01668 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1DQ01668 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1DQ01668 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1DQ01668 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1DQ01668 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1DQ01668 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1DQ01668 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1DQ01668 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1DQ01668 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1DQ01668 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1DQ01668 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1DQ01668 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1DQ01668 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1DQ01668 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1DQ01668 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1DQ01668 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1DQ01668 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1DQ01668 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CACNA1DQ01668 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1DQ01668 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1DQ01668 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1DQ01668 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1DQ01668 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1DQ01668 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1DQ01668 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1DQ01668 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1DQ01668 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1DQ01668 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1DQ01668 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1DQ01668 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1DQ01668 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1DQ01668 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1DQ01668 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1DQ01668 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1DQ01668 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1DQ01668 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1DQ01668 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1DQ01668 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA1DQ01668 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1DQ01668 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1DQ01668 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1DQ01668 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1DQ01668 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1DQ01668 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1DQ01668 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1DQ01668 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1DQ01668 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1DQ01668 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1DQ01668 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1DQ01668 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1DQ01668 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1DQ01668 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1DQ01668 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1DQ01668 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1DQ01668 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1DQ01668 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1DQ01668 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1DQ01668 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1DQ01668 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1DQ01668 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA1DQ01668 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1DQ01668 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1DQ01668 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1DQ01668 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1DQ01668 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1DQ01668 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1DQ01668 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1DQ01668 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1DQ01668 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1DQ01668 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1DQ01668 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1DQ01668 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1DQ01668 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1DQ01668 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1DQ01668 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1DQ01668 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1DQ01668 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1DQ01668 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1DQ01668 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1DQ01668 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1DQ01668 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1DQ01668 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1DQ01668 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1DQ01668 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1DQ01668 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNA1DQ01668 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms