Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA1P56199 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA1P56199 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA1P56199 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA1P56199 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA1P56199 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA1P56199 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA1P56199 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA1P56199 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA1P56199 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA1P56199 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA1P56199 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA1P56199 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA1P56199 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA1P56199 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA1P56199 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA1P56199 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA1P56199 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA1P56199 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA1P56199 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA1P56199 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA1P56199 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA1P56199 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA1P56199 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA1P56199 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA1P56199 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA1P56199 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA1P56199 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA1P56199 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA1P56199 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA1P56199 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA1P56199 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA1P56199 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA1P56199 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA1P56199 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA1P56199 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA1P56199 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA1P56199 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA1P56199 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA1P56199 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA1P56199 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA1P56199 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA1P56199 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA1P56199 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA1P56199 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA1P56199 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA1P56199 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA1P56199 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA1P56199 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA1P56199 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA1P56199 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA1P56199 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA1P56199 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA1P56199 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA1P56199 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA1P56199 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA1P56199 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA1P56199 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA1P56199 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA1P56199 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA1P56199 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA1P56199 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA1P56199 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA1P56199 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA1P56199 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA1P56199 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA1P56199 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA1P56199 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA1P56199 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA1P56199 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA1P56199 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA1P56199 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA1P56199 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA1P56199 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA1P56199 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA1P56199 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA1P56199 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA1P56199 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA1P56199 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA1P56199 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA1P56199 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA1P56199 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA1P56199 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA1P56199 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA1P56199 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA1P56199 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA1P56199 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA1P56199 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA1P56199 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA1P56199 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms