Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
AFDNP55196 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
AFDNP55196 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
AFDNP55196 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
AFDNP55196 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
AFDNP55196 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
AFDNP55196 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
AFDNP55196 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
AFDNP55196 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
AFDNP55196 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
AFDNP55196 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
AFDNP55196 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
AFDNP55196 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
AFDNP55196 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
AFDNP55196 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
AFDNP55196 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
AFDNP55196 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
AFDNP55196 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
AFDNP55196 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
AFDNP55196 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
AFDNP55196 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
AFDNP55196 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
AFDNP55196 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
AFDNP55196 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
AFDNP55196 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
AFDNP55196 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
AFDNP55196 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
AFDNP55196 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
AFDNP55196 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
AFDNP55196 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
AFDNP55196 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
AFDNP55196 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
AFDNP55196 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
AFDNP55196 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
AFDNP55196 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
AFDNP55196 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
AFDNP55196 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
AFDNP55196 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
AFDNP55196 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
AFDNP55196 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
AFDNP55196 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
AFDNP55196 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
AFDNP55196 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
AFDNP55196 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
AFDNP55196 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
AFDNP55196 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
AFDNP55196 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
AFDNP55196 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
AFDNP55196 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
AFDNP55196 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
AFDNP55196 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
AFDNP55196 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
AFDNP55196 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
AFDNP55196 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
AFDNP55196 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
AFDNP55196 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
AFDNP55196 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
AFDNP55196 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
AFDNP55196 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
AFDNP55196 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
AFDNP55196 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
AFDNP55196 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
AFDNP55196 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
AFDNP55196 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
AFDNP55196 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
AFDNP55196 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
AFDNP55196 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
AFDNP55196 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
AFDNP55196 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
AFDNP55196 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
AFDNP55196 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
AFDNP55196 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
AFDNP55196 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
AFDNP55196 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
AFDNP55196 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
AFDNP55196 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
AFDNP55196 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
AFDNP55196 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
AFDNP55196 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
AFDNP55196 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
AFDNP55196 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
AFDNP55196 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
AFDNP55196 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
AFDNP55196 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
AFDNP55196 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
AFDNP55196 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
AFDNP55196 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
AFDNP55196 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
AFDNP55196 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
AFDNP55196 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
AFDNP55196 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
AFDNP55196 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
AFDNP55196 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
AFDNP55196 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
AFDNP55196 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
AFDNP55196 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
AFDNP55196 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
AFDNP55196 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
AFDNP55196 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
AFDNP55196 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms