Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PIP4K2AP48426 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PIP4K2AP48426 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PIP4K2AP48426 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PIP4K2AP48426 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PIP4K2AP48426 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PIP4K2AP48426 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PIP4K2AP48426 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PIP4K2AP48426 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PIP4K2AP48426 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PIP4K2AP48426 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PIP4K2AP48426 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PIP4K2AP48426 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PIP4K2AP48426 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PIP4K2AP48426 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
PIP4K2AP48426 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PIP4K2AP48426 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PIP4K2AP48426 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PIP4K2AP48426 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PIP4K2AP48426 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PIP4K2AP48426 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PIP4K2AP48426 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PIP4K2AP48426 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PIP4K2AP48426 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PIP4K2AP48426 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PIP4K2AP48426 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PIP4K2AP48426 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PIP4K2AP48426 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PIP4K2AP48426 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PIP4K2AP48426 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PIP4K2AP48426 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PIP4K2AP48426 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PIP4K2AP48426 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PIP4K2AP48426 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PIP4K2AP48426 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PIP4K2AP48426 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PIP4K2AP48426 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PIP4K2AP48426 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PIP4K2AP48426 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PIP4K2AP48426 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PIP4K2AP48426 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PIP4K2AP48426 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PIP4K2AP48426 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PIP4K2AP48426 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PIP4K2AP48426 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PIP4K2AP48426 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PIP4K2AP48426 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PIP4K2AP48426 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PIP4K2AP48426 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PIP4K2AP48426 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PIP4K2AP48426 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PIP4K2AP48426 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PIP4K2AP48426 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PIP4K2AP48426 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PIP4K2AP48426 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PIP4K2AP48426 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
PIP4K2AP48426 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIP4K2AP48426 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PIP4K2AP48426 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PIP4K2AP48426 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PIP4K2AP48426 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PIP4K2AP48426 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PIP4K2AP48426 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PIP4K2AP48426 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PIP4K2AP48426 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PIP4K2AP48426 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PIP4K2AP48426 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PIP4K2AP48426 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIP4K2AP48426 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIP4K2AP48426 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIP4K2AP48426 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
PIP4K2AP48426 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIP4K2AP48426 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PIP4K2AP48426 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PIP4K2AP48426 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PIP4K2AP48426 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIP4K2AP48426 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PIP4K2AP48426 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PIP4K2AP48426 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PIP4K2AP48426 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PIP4K2AP48426 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIP4K2AP48426 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIP4K2AP48426 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIP4K2AP48426 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PIP4K2AP48426 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIP4K2AP48426 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
PIP4K2AP48426 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PIP4K2AP48426 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PIP4K2AP48426 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PIP4K2AP48426 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PIP4K2AP48426 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PIP4K2AP48426 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms