Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CAPN2P17655 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAPN2P17655 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAPN2P17655 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAPN2P17655 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAPN2P17655 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAPN2P17655 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAPN2P17655 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAPN2P17655 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAPN2P17655 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAPN2P17655 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAPN2P17655 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAPN2P17655 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CAPN2P17655 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CAPN2P17655 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CAPN2P17655 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAPN2P17655 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CAPN2P17655 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CAPN2P17655 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CAPN2P17655 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CAPN2P17655 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CAPN2P17655 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CAPN2P17655 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CAPN2P17655 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAPN2P17655 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAPN2P17655 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAPN2P17655 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CAPN2P17655 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAPN2P17655 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAPN2P17655 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CAPN2P17655 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CAPN2P17655 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CAPN2P17655 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CAPN2P17655 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CAPN2P17655 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CAPN2P17655 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CAPN2P17655 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAPN2P17655 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CAPN2P17655 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAPN2P17655 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CAPN2P17655 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CAPN2P17655 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAPN2P17655 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAPN2P17655 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CAPN2P17655 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CAPN2P17655 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CAPN2P17655 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CAPN2P17655 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CAPN2P17655 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CAPN2P17655 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CAPN2P17655 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CAPN2P17655 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CAPN2P17655 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CAPN2P17655 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAPN2P17655 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CAPN2P17655 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CAPN2P17655 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CAPN2P17655 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CAPN2P17655 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CAPN2P17655 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CAPN2P17655 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CAPN2P17655 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CAPN2P17655 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CAPN2P17655 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CAPN2P17655 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CAPN2P17655 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CAPN2P17655 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CAPN2P17655 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CAPN2P17655 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CAPN2P17655 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CAPN2P17655 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CAPN2P17655 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CAPN2P17655 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CAPN2P17655 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CAPN2P17655 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CAPN2P17655 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CAPN2P17655 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CAPN2P17655 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CAPN2P17655 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CAPN2P17655 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CAPN2P17655 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CAPN2P17655 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CAPN2P17655 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CAPN2P17655 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CAPN2P17655 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CAPN2P17655 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CAPN2P17655 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CAPN2P17655 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CAPN2P17655 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CAPN2P17655 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CAPN2P17655 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CAPN2P17655 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAPN2P17655 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAPN2P17655 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CAPN2P17655 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CAPN2P17655 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CAPN2P17655 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CAPN2P17655 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CAPN2P17655 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CAPN2P17655 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms