Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DMDP11532 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DMDP11532 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DMDP11532 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
DMDP11532 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
DMDP11532 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DMDP11532 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DMDP11532 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DMDP11532 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DMDP11532 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DMDP11532 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DMDP11532 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DMDP11532 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DMDP11532 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DMDP11532 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DMDP11532 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DMDP11532 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DMDP11532 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DMDP11532 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DMDP11532 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DMDP11532 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DMDP11532 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
DMDP11532 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DMDP11532 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DMDP11532 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DMDP11532 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DMDP11532 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DMDP11532 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DMDP11532 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DMDP11532 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DMDP11532 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DMDP11532 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DMDP11532 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DMDP11532 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DMDP11532 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DMDP11532 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DMDP11532 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DMDP11532 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DMDP11532 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DMDP11532 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DMDP11532 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DMDP11532 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DMDP11532 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DMDP11532 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DMDP11532 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DMDP11532 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DMDP11532 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DMDP11532 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DMDP11532 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DMDP11532 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DMDP11532 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DMDP11532 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DMDP11532 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DMDP11532 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DMDP11532 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DMDP11532 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DMDP11532 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DMDP11532 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DMDP11532 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DMDP11532 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DMDP11532 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DMDP11532 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DMDP11532 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DMDP11532 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DMDP11532 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
DMDP11532 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DMDP11532 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DMDP11532 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DMDP11532 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DMDP11532 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DMDP11532 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DMDP11532 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DMDP11532 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DMDP11532 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DMDP11532 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
DMDP11532 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DMDP11532 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DMDP11532 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DMDP11532 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DMDP11532 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DMDP11532 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DMDP11532 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DMDP11532 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DMDP11532 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DMDP11532 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DMDP11532 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DMDP11532 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DMDP11532 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DMDP11532 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
DMDP11532 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DMDP11532 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DMDP11532 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DMDP11532 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DMDP11532 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DMDP11532 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DMDP11532 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DMDP11532 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DMDP11532 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DMDP11532 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DMDP11532 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms