Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZIC2O95409 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZIC2O95409 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZIC2O95409 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZIC2O95409 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZIC2O95409 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZIC2O95409 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZIC2O95409 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZIC2O95409 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZIC2O95409 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZIC2O95409 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZIC2O95409 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZIC2O95409 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZIC2O95409 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZIC2O95409 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZIC2O95409 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZIC2O95409 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZIC2O95409 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZIC2O95409 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZIC2O95409 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZIC2O95409 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZIC2O95409 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZIC2O95409 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZIC2O95409 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZIC2O95409 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZIC2O95409 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZIC2O95409 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZIC2O95409 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZIC2O95409 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZIC2O95409 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZIC2O95409 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZIC2O95409 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZIC2O95409 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZIC2O95409 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZIC2O95409 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZIC2O95409 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZIC2O95409 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZIC2O95409 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZIC2O95409 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZIC2O95409 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZIC2O95409 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZIC2O95409 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZIC2O95409 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZIC2O95409 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZIC2O95409 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZIC2O95409 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZIC2O95409 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZIC2O95409 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZIC2O95409 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZIC2O95409 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZIC2O95409 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZIC2O95409 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZIC2O95409 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZIC2O95409 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZIC2O95409 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZIC2O95409 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZIC2O95409 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIC2O95409 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIC2O95409 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIC2O95409 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIC2O95409 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZIC2O95409 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZIC2O95409 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZIC2O95409 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZIC2O95409 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZIC2O95409 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZIC2O95409 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZIC2O95409 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZIC2O95409 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZIC2O95409 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZIC2O95409 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZIC2O95409 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZIC2O95409 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZIC2O95409 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZIC2O95409 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZIC2O95409 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZIC2O95409 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZIC2O95409 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZIC2O95409 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZIC2O95409 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZIC2O95409 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZIC2O95409 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZIC2O95409 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZIC2O95409 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZIC2O95409 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZIC2O95409 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZIC2O95409 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZIC2O95409 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZIC2O95409 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZIC2O95409 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZIC2O95409 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZIC2O95409 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZIC2O95409 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZIC2O95409 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZIC2O95409 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZIC2O95409 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZIC2O95409 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZIC2O95409 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZIC2O95409 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZIC2O95409 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms