Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF10O60809 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF10O60809 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF10O60809 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF10O60809 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF10O60809 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF10O60809 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF10O60809 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAMEF10O60809 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF10O60809 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF10O60809 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF10O60809 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF10O60809 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF10O60809 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF10O60809 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF10O60809 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF10O60809 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF10O60809 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF10O60809 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF10O60809 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF10O60809 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF10O60809 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF10O60809 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF10O60809 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF10O60809 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF10O60809 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF10O60809 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF10O60809 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF10O60809 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF10O60809 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF10O60809 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF10O60809 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF10O60809 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF10O60809 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF10O60809 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF10O60809 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF10O60809 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF10O60809 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF10O60809 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF10O60809 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF10O60809 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF10O60809 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF10O60809 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF10O60809 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF10O60809 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF10O60809 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF10O60809 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF10O60809 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF10O60809 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF10O60809 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF10O60809 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF10O60809 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF10O60809 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF10O60809 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF10O60809 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF10O60809 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF10O60809 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF10O60809 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF10O60809 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF10O60809 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF10O60809 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF10O60809 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF10O60809 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF10O60809 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF10O60809 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF10O60809 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF10O60809 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF10O60809 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF10O60809 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF10O60809 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF10O60809 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF10O60809 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF10O60809 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF10O60809 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF10O60809 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF10O60809 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF10O60809 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF10O60809 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF10O60809 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF10O60809 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF10O60809 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF10O60809 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF10O60809 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF10O60809 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF10O60809 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF10O60809 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF10O60809 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF10O60809 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF10O60809 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF10O60809 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms