Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
PLXNC1O60486 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
PLXNC1O60486 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
PLXNC1O60486 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
PLXNC1O60486 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
PLXNC1O60486 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
PLXNC1O60486 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
PLXNC1O60486 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.35■■■■■ 4.69
PLXNC1O60486 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
PLXNC1O60486 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
PLXNC1O60486 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
PLXNC1O60486 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
PLXNC1O60486 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
PLXNC1O60486 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
PLXNC1O60486 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
PLXNC1O60486 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
PLXNC1O60486 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
PLXNC1O60486 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
PLXNC1O60486 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
PLXNC1O60486 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
PLXNC1O60486 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
PLXNC1O60486 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
PLXNC1O60486 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
PLXNC1O60486 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
PLXNC1O60486 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
PLXNC1O60486 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
PLXNC1O60486 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
PLXNC1O60486 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
PLXNC1O60486 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.8■■■■■ 4.6
PLXNC1O60486 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
PLXNC1O60486 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
PLXNC1O60486 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
PLXNC1O60486 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
PLXNC1O60486 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
PLXNC1O60486 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
PLXNC1O60486 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
PLXNC1O60486 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.59
PLXNC1O60486 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
PLXNC1O60486 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
PLXNC1O60486 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
PLXNC1O60486 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
PLXNC1O60486 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
PLXNC1O60486 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PLXNC1O60486 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
PLXNC1O60486 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PLXNC1O60486 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
PLXNC1O60486 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
PLXNC1O60486 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
PLXNC1O60486 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
PLXNC1O60486 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
PLXNC1O60486 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
PLXNC1O60486 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC43.44■■■■■ 4.54
PLXNC1O60486 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
PLXNC1O60486 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PLXNC1O60486 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PLXNC1O60486 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
PLXNC1O60486 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
PLXNC1O60486 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
PLXNC1O60486 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PLXNC1O60486 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
PLXNC1O60486 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
PLXNC1O60486 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
PLXNC1O60486 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
PLXNC1O60486 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
PLXNC1O60486 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
PLXNC1O60486 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
PLXNC1O60486 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
PLXNC1O60486 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
PLXNC1O60486 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PLXNC1O60486 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PLXNC1O60486 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
PLXNC1O60486 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
PLXNC1O60486 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
PLXNC1O60486 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC42.94■■■■■ 4.47
PLXNC1O60486 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
PLXNC1O60486 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
PLXNC1O60486 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
PLXNC1O60486 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
PLXNC1O60486 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
PLXNC1O60486 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
PLXNC1O60486 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
PLXNC1O60486 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PLXNC1O60486 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
PLXNC1O60486 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.44
PLXNC1O60486 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
PLXNC1O60486 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PLXNC1O60486 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
PLXNC1O60486 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
PLXNC1O60486 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
PLXNC1O60486 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PLXNC1O60486 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PLXNC1O60486 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PLXNC1O60486 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
PLXNC1O60486 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PLXNC1O60486 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.66■■■■■ 4.42
PLXNC1O60486 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PLXNC1O60486 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PLXNC1O60486 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
PLXNC1O60486 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PLXNC1O60486 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms