Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN3BO60391 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN3BO60391 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GRIN3BO60391 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GRIN3BO60391 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GRIN3BO60391 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN3BO60391 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN3BO60391 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN3BO60391 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
GRIN3BO60391 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
GRIN3BO60391 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN3BO60391 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN3BO60391 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN3BO60391 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GRIN3BO60391 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN3BO60391 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN3BO60391 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GRIN3BO60391 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GRIN3BO60391 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GRIN3BO60391 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GRIN3BO60391 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GRIN3BO60391 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
GRIN3BO60391 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GRIN3BO60391 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GRIN3BO60391 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
GRIN3BO60391 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GRIN3BO60391 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GRIN3BO60391 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GRIN3BO60391 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN3BO60391 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
GRIN3BO60391 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN3BO60391 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN3BO60391 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN3BO60391 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN3BO60391 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN3BO60391 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GRIN3BO60391 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN3BO60391 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN3BO60391 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN3BO60391 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN3BO60391 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN3BO60391 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN3BO60391 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN3BO60391 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN3BO60391 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN3BO60391 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN3BO60391 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN3BO60391 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN3BO60391 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN3BO60391 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN3BO60391 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN3BO60391 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GRIN3BO60391 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GRIN3BO60391 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GRIN3BO60391 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GRIN3BO60391 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN3BO60391 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN3BO60391 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN3BO60391 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN3BO60391 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN3BO60391 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN3BO60391 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN3BO60391 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
GRIN3BO60391 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN3BO60391 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN3BO60391 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN3BO60391 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN3BO60391 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN3BO60391 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
GRIN3BO60391 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GRIN3BO60391 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN3BO60391 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN3BO60391 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GRIN3BO60391 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GRIN3BO60391 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GRIN3BO60391 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN3BO60391 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN3BO60391 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN3BO60391 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GRIN3BO60391 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GRIN3BO60391 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GRIN3BO60391 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GRIN3BO60391 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GRIN3BO60391 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
GRIN3BO60391 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GRIN3BO60391 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GRIN3BO60391 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
GRIN3BO60391 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GRIN3BO60391 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
GRIN3BO60391 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
GRIN3BO60391 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN3BO60391 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN3BO60391 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN3BO60391 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN3BO60391 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN3BO60391 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN3BO60391 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN3BO60391 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN3BO60391 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN3BO60391 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms