Protein–RNA interactions for Protein: O15105

SMAD7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD7O15105 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD7O15105 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD7O15105 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD7O15105 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD7O15105 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD7O15105 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD7O15105 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD7O15105 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD7O15105 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD7O15105 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD7O15105 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD7O15105 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD7O15105 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD7O15105 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD7O15105 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD7O15105 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD7O15105 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD7O15105 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD7O15105 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD7O15105 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD7O15105 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD7O15105 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD7O15105 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD7O15105 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD7O15105 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD7O15105 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD7O15105 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD7O15105 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD7O15105 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD7O15105 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD7O15105 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD7O15105 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD7O15105 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD7O15105 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD7O15105 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD7O15105 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD7O15105 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD7O15105 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD7O15105 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD7O15105 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD7O15105 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD7O15105 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD7O15105 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD7O15105 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD7O15105 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD7O15105 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD7O15105 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD7O15105 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD7O15105 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD7O15105 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD7O15105 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD7O15105 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD7O15105 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD7O15105 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD7O15105 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD7O15105 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD7O15105 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD7O15105 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD7O15105 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD7O15105 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD7O15105 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD7O15105 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD7O15105 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD7O15105 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD7O15105 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD7O15105 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD7O15105 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD7O15105 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD7O15105 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD7O15105 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD7O15105 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD7O15105 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD7O15105 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD7O15105 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD7O15105 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD7O15105 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD7O15105 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD7O15105 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD7O15105 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD7O15105 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD7O15105 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD7O15105 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD7O15105 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD7O15105 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD7O15105 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD7O15105 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD7O15105 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD7O15105 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD7O15105 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD7O15105 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD7O15105 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD7O15105 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD7O15105 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD7O15105 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD7O15105 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD7O15105 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD7O15105 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD7O15105 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD7O15105 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD7O15105 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms