Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF4O00268 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF4O00268 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF4O00268 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF4O00268 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF4O00268 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF4O00268 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF4O00268 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF4O00268 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF4O00268 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF4O00268 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF4O00268 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF4O00268 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF4O00268 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF4O00268 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF4O00268 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF4O00268 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF4O00268 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF4O00268 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF4O00268 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF4O00268 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF4O00268 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF4O00268 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF4O00268 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF4O00268 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF4O00268 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF4O00268 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF4O00268 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF4O00268 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF4O00268 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF4O00268 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF4O00268 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF4O00268 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF4O00268 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF4O00268 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF4O00268 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF4O00268 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF4O00268 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF4O00268 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF4O00268 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF4O00268 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF4O00268 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF4O00268 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF4O00268 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF4O00268 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF4O00268 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF4O00268 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF4O00268 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF4O00268 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF4O00268 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF4O00268 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF4O00268 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF4O00268 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF4O00268 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF4O00268 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF4O00268 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF4O00268 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF4O00268 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF4O00268 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF4O00268 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF4O00268 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF4O00268 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TAF4O00268 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF4O00268 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TAF4O00268 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF4O00268 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF4O00268 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TAF4O00268 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF4O00268 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF4O00268 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF4O00268 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF4O00268 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF4O00268 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF4O00268 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF4O00268 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF4O00268 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF4O00268 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4O00268 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF4O00268 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF4O00268 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF4O00268 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF4O00268 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF4O00268 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF4O00268 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF4O00268 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF4O00268 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF4O00268 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF4O00268 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF4O00268 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF4O00268 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4O00268 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF4O00268 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF4O00268 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF4O00268 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF4O00268 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF4O00268 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF4O00268 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF4O00268 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF4O00268 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF4O00268 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms