Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVH48-1M5A8F1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVH48-1M5A8F1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVH48-1M5A8F1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVH48-1M5A8F1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVH48-1M5A8F1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVH48-1M5A8F1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVH48-1M5A8F1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVH48-1M5A8F1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVH48-1M5A8F1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVH48-1M5A8F1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVH48-1M5A8F1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVH48-1M5A8F1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVH48-1M5A8F1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVH48-1M5A8F1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVH48-1M5A8F1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVH48-1M5A8F1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVH48-1M5A8F1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVH48-1M5A8F1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVH48-1M5A8F1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ERVH48-1M5A8F1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVH48-1M5A8F1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVH48-1M5A8F1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVH48-1M5A8F1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVH48-1M5A8F1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVH48-1M5A8F1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVH48-1M5A8F1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVH48-1M5A8F1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVH48-1M5A8F1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVH48-1M5A8F1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVH48-1M5A8F1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVH48-1M5A8F1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVH48-1M5A8F1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVH48-1M5A8F1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVH48-1M5A8F1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVH48-1M5A8F1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVH48-1M5A8F1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERVH48-1M5A8F1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVH48-1M5A8F1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVH48-1M5A8F1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVH48-1M5A8F1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVH48-1M5A8F1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVH48-1M5A8F1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVH48-1M5A8F1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVH48-1M5A8F1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVH48-1M5A8F1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVH48-1M5A8F1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVH48-1M5A8F1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVH48-1M5A8F1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVH48-1M5A8F1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVH48-1M5A8F1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVH48-1M5A8F1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVH48-1M5A8F1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVH48-1M5A8F1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVH48-1M5A8F1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVH48-1M5A8F1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVH48-1M5A8F1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVH48-1M5A8F1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVH48-1M5A8F1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVH48-1M5A8F1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVH48-1M5A8F1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVH48-1M5A8F1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVH48-1M5A8F1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVH48-1M5A8F1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVH48-1M5A8F1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVH48-1M5A8F1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVH48-1M5A8F1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVH48-1M5A8F1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVH48-1M5A8F1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVH48-1M5A8F1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVH48-1M5A8F1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVH48-1M5A8F1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERVH48-1M5A8F1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVH48-1M5A8F1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVH48-1M5A8F1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVH48-1M5A8F1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVH48-1M5A8F1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVH48-1M5A8F1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVH48-1M5A8F1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVH48-1M5A8F1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVH48-1M5A8F1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVH48-1M5A8F1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVH48-1M5A8F1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVH48-1M5A8F1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVH48-1M5A8F1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVH48-1M5A8F1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVH48-1M5A8F1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVH48-1M5A8F1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ERVH48-1M5A8F1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVH48-1M5A8F1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVH48-1M5A8F1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVH48-1M5A8F1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVH48-1M5A8F1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVH48-1M5A8F1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVH48-1M5A8F1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVH48-1M5A8F1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVH48-1M5A8F1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms