Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARFGEF1Q9Y6D6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms