Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H0

PCDHGA3, Protocadherin gamma-A3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA3Q9Y5H0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA3Q9Y5H0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA3Q9Y5H0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA3Q9Y5H0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA3Q9Y5H0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA3Q9Y5H0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA3Q9Y5H0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA3Q9Y5H0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA3Q9Y5H0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms