Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB12Q9Y5F1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB12Q9Y5F1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms