Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCTD3Q9Y597 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD3Q9Y597 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms