Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID1Q9ULK0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID1Q9ULK0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms