Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CGGBP1Q9UFW8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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