Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCOR3Q9P2K3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms