Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX43Q9NXZ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX43Q9NXZ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms