Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
XPNPEP3Q9NQH7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
XPNPEP3Q9NQH7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
XPNPEP3Q9NQH7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
XPNPEP3Q9NQH7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms