Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRA1Q9HD15 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRA1Q9HD15 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms