Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRC6CQ9HCJ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRC6CQ9HCJ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRC6CQ9HCJ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRC6CQ9HCJ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 596.6 ms