Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM39BQ9GZU3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39BQ9GZU3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms