Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD2Q9BZL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKD2Q9BZL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD2Q9BZL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms