Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG6Q9BXT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms