Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SGIP1Q9BQI5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SGIP1Q9BQI5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGIP1Q9BQI5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms