Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL3Q99963 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GL3Q99963 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms