Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
MYD88Q99836 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
MYD88Q99836 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYD88Q99836 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYD88Q99836 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYD88Q99836 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MYD88Q99836 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MYD88Q99836 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYD88Q99836 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYD88Q99836 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYD88Q99836 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYD88Q99836 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYD88Q99836 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms