Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHIPQ96QV1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HHIPQ96QV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms