Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ9

PRAP1, Proline-rich acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAP1Q96NZ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAP1Q96NZ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms