Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPNS2Q96L46 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPNS2Q96L46 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 477.2 ms